JMT日本医疗——多种皮肤症状根源不同的分子病态①

点击量：2036   日期：2023-11-24 10:46    编辑：JMT日本医疗

特应性皮炎除了根据症状的不同进行分类之外，还可以根据成为症状原因的遗传特征和生理学背景等进行分类。这种分类被称为末端类型，被认为与每个患者对特定治疗的反应差异密切相关。但是，还没有建立末端类型的分类方法。理化学研究所生命医科学研究中心免疫器官形成研究小组的关田爱子等人，实施过敏性皮炎患者的皮肤组织和血中的基因表达解析。研究人员发现，作为特应性皮炎被汇总起来的各种皮肤症状的根源与不同的分子病态有关。另外，通过历时1年的血液时间序列数据的分析，明确了每个患者的病情模式和基因表达变动模式相关等，并报告给Nat Commun（2023；14:6133）。

阐明与红斑和丘疹相关的基因表达模式

关田等人首先对115例特应性皮炎患者和14例健康人的皮肤组织及血液进行RNA测序分析，对各组织中的基因表达量进行了网罗性调查。为了调查特应性皮炎患者皮肤组织和血液的组织间的相互作用，着眼于细胞因子等可溶性因子及其受体的基因同时表达的状态（共表达）进行了组织间相互作用分析，结果与健康对照组相比，特应性皮炎患者组不仅是皮肤-皮肤，皮肤-血液的组织间相互作用的程度也在增加。

也就是说，皮肤组织和血液在相互作用的同时参与了特应性皮炎的病情，综合分析两者的基因表达量对于阐明病情是很重要的。

因此，研究人员根据基因间的共表达的大小对各组织中的基因表达量进行维度压缩。通过使用特应性皮炎患者的横断面数据，定义将共表达的基因彼此汇总成一个组的基因表达模块，不仅能够大幅减少数据维数，而且能够强调特应性皮炎的特征性基因表达模式。

分析的结果，分别在皮肤组织中鉴定了21个模块，在血液中鉴定了15个模块。利用Human Protein Atlas等公共数据库的分析表明，构成这些模块的基因群在各免疫细胞种和皮肤细胞种中具有特异性的表达模式，与免疫控制和代谢等特定分子的反应有关。

这表明这些模块是反映与特应性皮炎的病症相关的生物学功能的基因群体。

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