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JMT日本医疗——日本发现对EGFR变异肺癌具有耐药功能的融合基因的识别方法①

点击量:175   日期:2022-10-17 10:08    编辑:JMT日本医疗

国立癌症研究中心于10月7日宣布,通过患者治疗及细胞实验,全面调查了包括日本人在内的占亚洲人肺腺癌半数的EGFR基因变异的肺癌作为耐药机制的融合基因,发现了实际上成为耐药原因的和不是耐药原因的区分方法和克服的有效的并用疗法。这项研究是美国Dana-Farber Cancer Institute的Dr。由Pasi A.Jänne、国立癌症研究中心研究所分子病理领域的以小林祥久研究员为中心的国际共同研究小组组成。研究成果刊登在“Nature Communications”上。

 

肺癌是死亡人数最多的癌症物种。在肺腺癌中,包括日本人在内的亚洲人的半数,欧美人的约20%可以看到EGFR基因的活性型变异。对于进展期及复发的EGFR基因变异肺癌,第三代EGFR酪氨酸激酶抑制剂(奥西梅替尼)成为标准治疗,但问题是约1~2年后获得耐药性而失效。到目前为止,作为耐药机制“由于药剂结合袋的结构变化,药物无法结合(例如EGFR C797S二次变异)”“EGFR基因以外的其他致癌基因的变异、基因扩增、融合基因发出致癌信号”“腺癌向其他种类的病理组织的转换(小细胞癌、扁平上皮癌)”等,在研究阶段作为其克服方法,还没有标准治疗化的方法。

 

即使是下一代测序器,技术上也很难检测出融合基因

 

DNA是埃克森和内含子交替重复的序列。在从DNA转录到mRNA并翻译成氨基酸序列的过程中,发生了去除内含子并仅连接外显子的剪接。大多数融合基因的breakpoint(切割点)位于内含子中。分析DNA序列的新一代测序器的技术正在发展,特别是由于以下两个理由,融合基因的检测在技术上有很多困难。

 

一种情况是,用于检测导致患者治疗的基因突变的面板(一组待分析的基因区域)中预先设定了外显子的热点突变作为靶点,并且内含子通常不包含在靶点中。另一方面,在内含子中随处可见重复序列,根据在下一代测序器中读到的长度为100~200个碱基左右的序列,往往难以鉴定是哪个基因内含子的一部分。

 

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