JMT日本医疗——构建新分析法，成功诊断6例遗传学上未诊断的神经肌肉疾病②

点击量：80   日期：2022-11-02 11:18    编辑：JMT日本医疗

对59个致病基因区域进行选择性排序，构建快速发现的分析法和诊断流程图

此次研究使用了GridION测序仪搭载的自适应采样新技术。该方法是一种实时判断目标基因区域的DNA片段是否符合要求，并仅对目标区域进行有效序列的技术。通过这种方法，将患者的DNA投入到测序仪中，只能够选择性地对59个已知会导致重复病的基因区域进行测序。

重复序列的长度存在很大的个体差异，正常重复长度和病态重复长度不容易区分。如果重复序列的长度明显超出正常范围，其中所包含的序列也可能不具有病原性。因此，有时很难判断检测出的重复扩展序列是否病态。因此，这次的研究是通过分析管道，在获得的长期读取序列数据中包含的59个基因区域的重复序列中，对可能引发疾病的序列进行排序，构筑了迅速发现原因的分析管线和诊断流程图。

在现有的10个病例中，有6个病例通过遗传学确诊

首先，对以往法中确定具有病态重复伸长序列的12例神经肌肉疾病（阳性控制）进行长读序列，用构筑的管线进行分析，结果检测出所有患者的疾病原因重复伸长。接着，对临床诊断为脊髓小脑变性症，但没有得到遗传学诊断的10个病例，进行了该目标长期读取序列(T-LRS)分析。另外，为了进行比较，还同时进行了传统的基因检查，并核对了结果。结果，T-LRS法在7个病例中检测出偏离正常范围的重复伸长(CACNA1A基因2个病例，BEAN1基因2个病例，ATXN8OS/ATXN8基因1个病例，RFC1基因2个病例)，其中有6例是可以判断为确实会发病的病态重复伸长，从遗传学上可以确定诊断。其中有1个病例，用以前的方法很难检测出重复序列的轻微伸长，被判定为原因不明，但是通过T-LRS方法可以诊断为脊髓小脑变性症6型。

在4天内全面分析所有已知重复伸张疾病的基因区域

本次开发的T-LRS法可以在约4天以内对已知的全重复伸长疾病的基因领域进行网罗性分析，与对怀疑原因的基因领域进行每一处分析的以往方法（1疾病分析）相比，在快速性和准确性方面是优异的。另外，通过使用本次研究中开发的诊断流程图，能够从长读序列中得到的数据中容易地找到原因。

本次研究表明，T-LRS法在重复延伸病中是一种准确有效的分析方法。据报道，在病态重复延伸中，延伸重复序列的碱基模式是影响遗传不稳定性、疾病预后和病程的因素。从本次分析得到的数据不仅作为诊断，作为患者的预后预测等的判断材料也是有用的信息。研究小组表示：“今后，T-LRS法的网罗性快速诊断系统​有望对重复性疾病的基因诊断和医学管理做出很大贡献。”

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