JMT日本医疗——阐明与特应性皮炎个体化医疗相关的遗传基因表达模式②

点击量：5367   日期：2023-11-03 10:23    编辑：JMT日本医疗

AD患者发现皮肤-血液的相互作用增大，两者的基因表达的综合分析很重要

因此，本次研究着眼于红斑和丘疹这两种特征性皮疹性状，旨在从这些与特定基因表达的关系性来阐明AD的病态多样性。此外，还尝试阐明了症状的经时性变化与基因表达变动模式的关联。研究组首先对115名AD患者和14名健康人的受试者的皮肤组织和血液进行RNA序列，网罗性地调查了各组织中的基因表达量。

为了研究AD患者的皮肤组织和血液组织之间的相互作用，进行了着眼于细胞因子等可溶性因子及其受体的基因同时表达的状态（共表达）的组织间相互作用分析。结果显示，AD患者组与健康组相比，除了皮肤-皮肤的组织内相互作用之外，皮肤-血液的组织间相互作用的程度也增大。也就是说，皮肤组织和血液在相互作用下参与AD的病态，认为综合分析两者的基因表达量对病态阐明很重要。

定义共表达的基因群的模块，在AD患者皮肤组织中21血液中鉴定15

不同组织的RNA序列数据由于表达量的分布有很大的不同，如果单纯地结合皮肤和血液的绝对表达量，则难以解释。另外，由于在RNA序列中可得到2万个左右的基因的表达数据，因此若将多个组织的数据组合，则解析表达量的关系的指标的数量（维数）变得庞大。

因此，研究组根据基因间共表达的大小，对各组织中的基因表达量进行维度压缩。通过使用AD患者横断数据，定义将共表达的基因彼此集中在一个组中的基因表达模块，不仅可以大幅减少数据维数，还可以强调AD中特征性的基因表达模式。

在该分析中，可以分别识别皮肤组织中的21个模块、血液中的15个模块。利用公共数据库上的数据分析表明，构成这些模块的基因群在各免疫细胞种和皮肤细胞种中具有特异性的表达模式，并且与免疫控制和代谢等特定分子的反应有关。也就是说，这些模块被认为是反映了与AD的病症相关的生物学功能的基因群体。

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