JMT日本医疗——基因组分析急性红白血病分为4个子群,并发现治疗靶点①
点击量:98 日期:2022-08-11 08:50 编辑:JMT日本医疗
AEL被分类为AML的一种,病情发展迅速且没有有效治疗的病例
京都大学于8月5日宣布,利用新一代测序仪对124例急性红白血病(AEL)进行了全面的基因组分析,根据变异特征,AEL可分为4个子群。该研究是该大学医学研究科的小川诚司教授、竹田淳惠研究员等研究小组的成果。研究成果在线发表在《Blood Cancer Discovery》上。
AEL是一种以幼弱幼粒细胞显著增殖为特征的罕见白血病,在目前WHO的分类中被归类为急性骨髓性白血病(AML)之一,是骨髓中幼粒细胞比例、分化程度极为显著的纯红白血病(PEL)。和其他AML一样,被分类为骨髓母细胞增多的红血球/骨髓性白血病(EML)。
近年来,在基因组分析技术不断革新的背景下,有关AEL的TP53变异也出现了高频率的发现。但是其他的AML也承认TP53变异,所以不能充分说明特征性的赤子球增多的原因。另外,在AEL中,目前正在进行其他AML标准的治疗,但是一部分病例的病情进展非常明显,对于这样的病例,至今还没有确立有效的治疗方法。因此,此次研究小组采用了最先进的基因组分析方法,试图阐明表征AEL的基因异常及其分子病理。
对AEL124病例进行全面基因组分析,分为A ~ D个子群
研究小组首先对121名成人AEL发病病例的骨髓或外周血中调整的基因组DNA,使用新一代测序仪进行分析,在分析AEL的特征性基因变异后,与已经报告的3例对共计124例进行了全面解析。结果表明,成人AEL的TP53、NPM1、STAG2基因几乎没有重复,频率很高,根据这些基因变异的有无,大致可以分为四类(A ~ D)。这些变异在其他AML中也经常被发现,但是比较具有各自变异的AEL和非AEL的AML后发现,AEL中除了上述变异之外,还经常在 AEL 中观察到 AEL 特征性突变。
TP53高频率变异,JAK2、EPOR、ERG、ETS2染色体放大部分
特别是四组中频率最高的是TP53变异,约占40%(50/124)。TP53是人类癌症中变异频率最高的抑癌基因,研究表明,TP53的变异和功能丧失有助于致癌。在携带该变异的病例中经常发现复杂的染色体,在AEL中TP53异常情况下也发现了复杂的染色体异常,其中第9、19、21号染色体在AEL中出现了特征性的高频率扩增。因此,为了寻找受这些扩增影响的“目标基因”,我们详细探讨了不同病例共同扩增的区域。
对50例具有TP53变异的AEL的染色体的扩增区域进行了确认,发现既有扩增范围广的病例,也有局限于狭窄区域的高度扩增的病例。共同扩增部分分别包括JAK2、EPOR、ERG、ETS2,这些被认为是与AEL发病相关的扩增的目标基因。
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