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JMT日本医疗——肝癌的分子分类与治疗药物选择②

点击量:191   日期:2022-11-16 10:04    编辑:JMT日本医疗

癌症是由于基因组异常积累而发病、进行的“基因组疾病”。国际共同研究小组,到现在为止把肝炎病毒关联的肝癌做为中心根据全基因组序列解析的基因组变异,RNA序列解析推进了肝癌的肿瘤免疫的研究。鉴定了各种各样的基因组异常,阐明了基因组异常、肿瘤免疫和肝癌发病的关系。

 

但是,在癌症中发现的很多变异信息的意义依然不明,与肝癌的治疗方针和新的治疗方法的开发直接相关的例子并不多。作为其原因,基因组是设计图,另一方面,实际上在癌症的发生和增殖中发挥作用的是蛋白质,分子靶向治疗药​也是抑制激酶等蛋白质的功能。因此,这次我们考虑通过获得癌症中的治疗目标和在癌症中活性化的功能性蛋白质的表达信息,是否能与更恰当的治疗方针相关联,进行了研究。

 

研究方法成果

 

国际共同研究小组从迄今为止在理研进行全基因组测序分析的300例以上日本人肝癌中残存的259例冷冻标本中提取蛋白质,由美国MD安德森癌症中心和岩手医科大学的西冢哲特任教授等人开发通过RPPA法进行了大规模蛋白质分析(图1左)。

 

以作为癌症治疗目标的信号分子、激酶、激酶的磷酸化蛋白质为主体,使用293个抗体制作了蛋白质表达曲线。RPPA法是迄今为止在美国大规模癌症基因组数据库TCGA中采用的分析技术,拥有500例使用同一平台的肝癌蛋白质表达数据,其数据也在本次分析中进行了比较研究。另外,还测定了承担血管新生因子中心功能的磷酸化VEGFR2的量。

 

根据这些数据,进行了聚类分析,这次日本人的肝癌可以分为三组(R1、R2、R3)(图1右)。TCGA的肝癌数据也确认了同样的3个分类,再现性也得到了证明。

 

JMT日本医疗——肝癌的分子分类与治疗药物选择②

RPPA法肝癌分子分类及最佳治疗药物选择图

 

通过使用约300种抗体的RPPA法,制作肝癌的功能性蛋白质的表达曲线,进行三个分子分类(R1、R2、R3)。蛋白质表达谱中的红色显示高表达或活化,蓝色显示低表达或低活性。右下角为各组最佳治疗药物的选择结果。

 

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