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JMT日本医疗——日本阐明了卵巢癌的致癌机制②

点击量:5005   日期:2023-10-23 10:18    编辑:JMT日本医疗

研究方法及成果

 

高异型度浆液性卵巢癌大多是由输卵管采集(像输卵管前端的手一样的部分)中存在的输卵管分泌上皮细胞(HTFSEC)引起的,发生前癌病变(输卵管上皮内癌),之后在卵巢表面播种,从而发展为卵巢癌。国际联合研究组对输卵管分泌上皮细胞进行了阶段性基因导入,建立了同源重组修复途径分子无异常、预后不良亚型高异型度浆液性卵巢癌阶段性致癌模型细胞(H、HT、HTK、HTKA、HTKM)实施了包含网罗性的表基因组分析的泛组学分析(图1a)。

 

RNA-seq分析结果证实,随着癌基因的导入,致癌模型细胞的性状发生了阶段性的变化。并且,作为代表性的表基因组分析方法,能评价基因组的开放色素区域的ATAC-seq分析,与RNA-seq相比,能更清楚地提取获得了肿瘤形成能力的细胞(HTKA,HTKM)的轮廓(图1b)。这表明表基因组分析对于获取准确的细胞信息是很重要的。

 

以ATAC-seq数据为基础,对转录因子的DNA结合模式[13]的变动进行了网罗性评价,结果发现在获得肿瘤形成能力的过程中,AP-1家族的转录因子活性化,另一方面GATA家族的转录因子失活(图1c、d)。

 

JMT日本医疗——日本阐明了卵巢癌的致癌机制②

高异型度浆液性卵巢癌致癌模型细胞的泛组学分析图

 

a:高异型度浆液性卵巢癌阶段性致癌模型细胞的轮廓。对正常来源细胞的输卵管分泌上皮细胞(HFTSEC)进行基因导入,制成不死化HFTSEC(H、HT、HTK)。在不死化HFTSEC中导入癌基因,建立肿瘤形成HFTSEC(HTKA、HTKM)。对每个样品进行的分析描述在序列项目中。

 

b:RNA-seq(左)和ATAC-seq(右)数据进行主成分分析。可以确认沿着基因导入阶段的变化。在ATAC-seq中可以清楚地分离出在RNA-seq中不能有效分离的肿瘤形成HFTSEC HTKA样品。

 

c:ATAC-seq数据,进行网罗性的转录因子Motif分析。在肿瘤形成HFTSEC的HF1/TP53/KRAS/AKT(HTKA)样品中,GATA家族的转录因子失活(左)。另外,在HF1/TP53/KRAS/MYC(HTKM)样品中,AP-1家族的转录因子被激活(右)。

 

d:通过热图显示GATA家族(左)和AP-1家族(右)在阶段性致癌过程中的转录因子的增强膜核心。GATA家族沿着阶段性的致癌过程被灭活,AP-1家族被活化。

 

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